Другое соединение, сложный и распространенный механизм в мозгу и теле, разрешает единственному гену создавать разнообразие белков, и его дисрегуляция была вовлечена во многие болезни. Генетические варианты, названные соединением количественных мест черты либо sQTLs, руководят другим процессом соединения, но до сих пор воздействие этих вариантов в мозгу не прекрасно осознано.
Исследователи в Brain Science Institute (BSI) RIKEN и Муниципальном университете Иокогамы в Японии составили всесторонний перечень sQTLs в примерах ткани людской мозга и сделали вывод, что эти варианты были обогащены среди геномных регионов, которые связаны с шизофренией, в дополнение к вторым связанным с заболеванием местам.Победите автора Ацуши Тэкэту, и сотрудники начали с информации об упорядочивающем РНК, взятых из мозговой ткани больше чем 200 человек, у которых, до смерти, не было известного психологического заболевания. Они сперва выяснили тысячи единственных полиморфизмов нуклеотида (SNPs), неспециализированных генетических вариантов с возможными регулирующими ролями в формировании РНК посыльного и соединении альтернативы – в этом контексте, эти SNPs названы sQTLs. «Мы считаем, что эти sQTLs смогут оказать помощь нам осознать генетическую архитектуру расстройств психики, таких как шизофрения», сообщил Тэдэфуми Като, ведущий лидер и автор исследовательской группы в RIKEN BSI.Потом исследуя сотрудничество sQTLs с известными генетическими регулирующими элементами, исследователи нашли образцы большого обогащения либо истощения среди определенных мест, каковые связывают отметки гистона и транскрипционные факторы.
Места, которые связаны с шизофренией, определенные прошлыми изучениями ассоциации всего генома, как кроме этого обнаружили, были обогащены для sQTLs, в особенности non-exonic sQTLs, предлагая соединение регулирования, а не ДНК К БЕЛКУ, кодирующей как содействующий механизм. «Прошлые изучения показали, что другие QTLs, такие как выражение (eQTLs) и methylation (mQTLs), содействуют риску шизофрении», сообщил Тэкэта, обратившись к регулированию генного уровня, которое довольно часто включает эпигенетические трансформации, «но это новое открытие додаёт sQTLs к репертуару генетических механизмов, растолковывающих риск шизофрении».Это изучение было основано на статистических ассоциациях, так, следующий ход будет экспериментальной проверкой функции определенного sQTLs на другом соединении. Но лишь, исследуя, где sQTLs интереса превалировали в геноме, исследователи выяснили местонахождение четырех генов чувствительности заболевания для шизофрении, на каковые воздействуют при помощи другого соединения.
Эти гены, NEK4, FXR1, SNAP91 и APOPT1, содействуют, среди другого, передача нервного импульса, развитие нервной совокупности и апоптоз.«Обогащение sQTLs в местах, которые связаны с шизофренией показывает, что эти варианты содействуют риску заболевания», подвел результат Като, «но это – всего одна часть геномного пейзажа сложного заболевания мозга».
Управляемый данными подход, применяемый тут, может выяснить генетические гены-варианты и дальнейшие кандидаты, в особенности вне единственного отдела головного мозга, что был центром данного изучения, и употребляться, дабы произвести модели животных заболевания.