Генетический скрининг выявляет гены, вызывающие резистентность, с помощью библиотеки направляющих РНК

Исследователи разработали метод создания всеобъемлющей библиотеки мутаций по всем генам в геноме мыши. Эту библиотеку можно использовать для изучения роли каждого гена в разных типах клеток.

Технология CRISPR использует ДНК-режущий фермент Cas9 с помощью направляющей последовательности РНК для поиска и модификации генетических мишеней. Ученые могут легко создать несколько новых направляющих РНК, используя стандартные методы молекулярной биологии. Это обеспечивает гораздо более быстрый и эффективный метод модификации генома любого типа клеток любого вида.

Команда обнаружила, что 50 из 52 протестированных направляющих РНК успешно разрезают обе копии генов. Чрезвычайно высокий уровень успеха этих сконструированных направляющих РНК, по-видимому, одинаков для многих типов клеток, что привело их к созданию библиотеки направляющих РНК, нацеленных на каждый ген в геноме мыши.

"Технология CRISPR революционизирует то, как мы изучаем поведение клеток," говорит доктор Косуке Юса, ведущий автор из Wellcome Trust Sanger Institute. "Мы разработали обширную библиотеку, которую могут использовать другие исследователи для изучения роли любого гена. Мы можем создать библиотеку этого типа для любой клетки или любого вида."

Команда разработала библиотеку из почти 90000 этих направляющих РНК, которые можно использовать для нацеливания и модификации каждого гена в геноме мыши, и создала библиотеки мутантных стволовых клеток. Они подвергли мутантные библиотеки генетическому скринингу против бактериального токсина, альфа-токсина Clostridium septicum, чтобы лучше понять, как может возникнуть устойчивость: этот агент оказывает токсическое действие на все типы клеток.

Команда нацелена на 26 генов, которые, как известно, связаны с синтезом рецепторов этого бактериального токсина. Они обнаружили, что 17 из этих генов ответственны за устойчивость. Важно отметить, что они также идентифицировали ранее неизвестные гены, мутации которых придают устойчивость к этому токсичному агенту.

Теперь команда будет использовать эту библиотеку для создания мутаций в линиях раковых клеток. Основная проблема противораковых препаратов заключается в том, что часто клетки могут быстро приобрести резистентность и отказаться от лечения. Путем скрининга генов, которые потеряли все функции в результате мутации, команда может определить, какие гены участвуют в приобретении устойчивости к лечению рака, и, таким образом, найти клиническую мишень.

5 комментариев к “Генетический скрининг выявляет гены, вызывающие резистентность, с помощью библиотеки направляющих РНК”

  1. Благого времени суток! Не зрю обстоятельства внедрения сообщений. Позволительно ли воспроизводить набросанный вами текст на свой ресурс, если ставить гиперссылку на эту вэб-страницу?

Оставьте комментарий