Учитывая непомерную цена расшифровки геномов, большая часть лабораторий кинуло упорядочивать и покинуло ту работу большим последовательным центрам. Но сейчас, две группы с далека способы, которые могут сделать последовательные намного более недорогие и более стремительные, многообещающие маленькие лаборатории шансом сделать это самостоятельно.Исследователи во всем мире все еще зависят от последовательного способа пару введенных десятилетия назад Фреда Сэнджера из Лаборатории Молекулярной биологии в Кембридже, Англия, которую Это применяет бактерии для усиления ДНК и дорогих реактивов для маркировки баз для идентификации. Цена понизилась с середины 1990-х больше чем от 1$ до меньше, чем 10-й из цента за базу.
Но это все еще высоко для многих проектов, включая медицинское применение, такое как проверка геномов людей.Новые способы – один развитый Джорджем Черчем, вычислительным химическим инженером в Медицинской школе Гарварда в Бостоне, и сотрудниках и втором Йонатаном Ротбергом, основателем 454 Life Sciences Corp. в Брэнфорде, Коннектикут – экономит деньги методом спасения от миниатюризации процесса и необходимости бактерии.
Вместо бактерий ДНК присоединена к водным бусинкам, заключенным в нефть, где химические реакции делают копирование. Одно лишь то изменение имело возможность уменьшить двумя третями затраты, которые связаны с персоналом и пространством, говорит Эдуард Рубин, директор американского Университета Генома Сустава Министерства энергетики в Уолнат-Крике, Калифорния.
Помимо этого, оба способов делают довольно много тысяч этих последовательных реакций сходу в миниатюрных «реакторах», потом снижая цена.Когда ДНК готова, эти две разработки отличаются: 454 способа помещают бусинки на волоконно-оптический чип и применяют вспышки белого света для идентификации баз. Rothberg вымывает поверхность чипа с одной базой за один раз, создавая четыре легких примера, которые компьютер соединяет как последовательность. Он обрисовывает 454’s успех в последовательной Микоплазме genitalium онлайн 31 июля по собственной природе.
Способ церкви применяет микроскоп и второе стандартное оборудование, применяющее взрывы разных флуоресцентных цветов для различения баз. Посредством этого способа его бригада упорядочила напряжение кишечной палочки и смогла найти легкие мисс трансформации единственной пары азотистых оснований от практически аналогичного E. coli геном. Несколько церкви информирует о собственных итогах онлайн сейчас в Науке.
Никакой способ еще не до скорости. Точность обоих «должна быть улучшена по крайней мере одним порядком величины», говорит Мустафа Ронэги, биохимик в Стэнфордском университете в Пало-Альто, Калифорния. Помимо этого, к геномам млекопитающего, относящееся к млекопитающим последовательности протяженность сгенерированной последовательности, «прочтённый», должна быть примерно 700 базами, но просматривает с этими новыми подходами, колеблются между 26 и 110 базами.Безотносительно их ограничений два отчета сигнализируют восход солнца новой эры в геноме последовательные и обнаруживающие трансформации в отдельных геномах.
В прошедшем сезоне американский Национальный НИИ Генома человека в Молитвенном доме, Мэриленд, начал программу, нацеленную на уменьшение цены последовательных геномов млекопитающих к 100 000$ через 5 лет и к 1 000$ 5 лет спустя. Это – то, что многие считаюм, что это заберёт для упорядочивания для становления дешёвым в маленьких лабораториях.