Одним из критических барьеров в усилиях по борьбе с пандемией COVID-19 был относительно высокий уровень ложноотрицательных результатов наиболее часто используемых методов тестирования с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Часто эти методы не могут определить более низкую вирусную нагрузку, которая обычно присутствует у бессимптомных лиц, но ниже предела обнаружения (LoD) стандартных одно- или двухэтапных методов ОТ-ПЦР. Исследователи из Биологической программы Нью-Йоркского университета в Абу-Даби и Центра геномики и системной биологии (CGSB) внедрили новый трехэтапный подход к тестированию, который обещает значительно – и с минимальными затратами – повысить точность тестирования.
Вместо того, чтобы комбинировать реакции RT и qPCR, исследователи NYUAD под руководством профессора биологии NYU и NYUAD Криса Гансалуса и доцента биологии NYUAD Юссефа Идагдура использовали технику, включающую последовательную RT, преамплификацию кДНК и qPCR, с использованием микрожидкостной платформы.
Исследователи продемонстрировали надежное сверхчувствительное и количественное определение низких вирусных нагрузок SARS-CoV-2 (менее одной копии на микролитр) с использованием синтетической вирусной РНК, клинических образцов носоглоточного мазка и образцов слюны, включая образцы, ранее признанные отрицательными при клинических диагностических исследованиях. Их выводы, опубликованные в журнале Processes, заключаются в том, что этот микрожидкостный анализ ОТ-ПЦР является чувствительной, количественной и рентабельной стратегией обнаружения, которая может заметно снизить количество ложноотрицательных результатов клинических диагностических тестов – потенциально ценный инструмент при SARS-CoV- 2 программы активного скрининга и раннего выявления.
"Добавив этап предварительной амплификации и используя микрожидкостную технологию, мы продемонстрировали, что этот чувствительный метод обнаружения может обнаруживать низкие вирусные нагрузки, что имеет решающее значение для обеспечения наиболее эффективных ответных мер общественного здравоохранения на пандемию COVID-19," сказал Идагдур. "Наш трехэтапный подход может значительно снизить количество ложноотрицательных результатов стандартных диагностических тестов на основе ОТ-ПЦР для SARS-CoV2 и других вирусных инфекций. Это позволит должностным лицам общественного здравоохранения более легко выявлять и отслеживать бессимптомных лиц, повысить точность отбора проб воздуха и окружающей среды на SARS-CoV-2, расширить возможности точного обнаружения до анализа слюны и помочь ограничить распространение вируса."