Исследователи рака нашли новую генетическую аномалию в опухолевых клетках, устанавливающую их не считая обычных клеток. У людей и мышей, раковые клетки провернули солидные суммы определенного типа РНК, проигнорированной до сих пор.
Открытие имело возможность пролить свет на то, как рак развивается, и это имело возможность дать патологам новый маркер для обнаружения раковых клеток в биопсии.Постдокторский исследователь Дэвид коллеги и Тинг в лаборатории генетика рака Дэниела Хабера из Центральной поликлиники Массачусетса в Бостоне нашли, что их новый маркер при помощи последовательной автомобили нового поколения измерил молекулы РНК либо расшифровки стенограммы, закодированные ДНК раковой клетки. В отличие от классических микромножеств, усеянных ДНК-зондами, измеряющими деятельность подмножества 20 000 генов клетки, этот «цифровой» анализ экспрессии гена соответствовал всем расшифровкам стенограммы РНК.
К удивлению ученых большой части расшифровок стенограммы РНК в первом примере они удостоверились в надежности — мышь, опухоль поджелудочной железы — была закодирована типом последовательности ДНК, названной спутниковыми повторениями. Это маленькие, повторные протяжения ДНК, не кодирующие для протеинов. Потому, что спутниковые повторения не считали серьёзными, микромножества не проверяют на их выражение, говорит Хабер.У восьми из 10 мышей опухоли поджелудочной железы уровень спутниковых расшифровок стенограммы был оглушением, 40-кратным выше, чем у обычной мыши клетки поджелудочной железы, информирует бригада онлайн сейчас в Науке.
Результаты были подобны при людских опухолях: большой уровень определенной спутниковой РНК при 15 из 15 людской рака поджелудочной железы, а также в маленькой выборке простаты, легкого, яичниковых опухолей и почки при сравнении с обычными клетками человека.В то время как бригада Хабера, запятнанная эта спутниковая РНК в ткани поджелудочной железы, удаленной для биопсии, они продемонстрировали, что раковые клетки светло выделились (см. изображение), даже на ранних стадиях заболевания. Маркер имел возможность оказать помощь улучшить диагноз рака, говорят исследователи.
Довольно часто, доктора, подозревающие рак в органе, будут применять иглу, чтобы собрать пару клеток и изучить их форму. Не обращая внимания на то, что это опробование менее враждебно, чем хирургическая биопсия, это не столь совершенно верно — Тинг говорит, что лишь 60% к 80% образцов поджелудочной железы, взятых так, верно диагностированы.
Патолог Ральф Хрубэн из Медицинской школы Университета Джонса Хопкинса в Балтиморе, Мэриленд, кто говорит окрашивание клетки, есть «достаточно впечатляющим», соглашается, что это имело возможность оказать помощь с биопсиями, которые тяжело трактовать.Несколько Хабера сохраняет надежду применять маркер для улучшения их чипа распространения опухолевой клетки (CTC), устройства, отлавливающего раковые клетки, плавающие в примере крови больного. Способ надеется на маркеры протеина для различения раковых клеток от обычных клеток, заманенных в ловушку чипом, но никаким существующим сокращением маркеров через типы рака. (Не обращая внимания на то, что раковые клетки постоянно несут мутации и неправильно выраженные гены, до сих пор никакое единственное генетическое затруднение не отличило раковые клетки от обычных клеток.) «Это, думается, так значительно отличается», говорит Хабер.
Но его несколько еще не решила, как найти спутниковую РНК в клетках, заманенных в ловушку чипом CTC.В будущем большой уровень спутникового выражения имел возможность оказать помощь продемонстрировать, как рак развивается. «Это страно, и это указывает что-то.
Но в этом пункте мы не знаем то, что это указывает», говорит биолог рака Тайлер Джекс из Массачусетского технологического университета в Кембридже. Несколько Хабера отыскала, что большие уровни РНК коррелируют с выражением определенных генов, вовлеченных в эмбриональное развитие — предполагающий, что рак имел возможность применять обычные программы развития для развития.
Но исследователи все еще должны узнать, по какой причине спутниковые уровни РНК так высоки и содействуют ли они раку либо являются легко побочным эффектом некоего другого процесса.