ХОЛОДНАЯ ВЕСЕННЯЯ ГАВАНЬ, НЬЮ-ЙОРК – геном человека был упорядочен, но вычисление числа генов, которые это содержит, занимает больше времени. Специалисты по ДНК, однако, сделали вывод, что знают, кто сделал добрейшее предсказание: Ли Рауэн. Сиэтлская программа упорядочения и два из ее сотрудников были заявлены победителем на этой неделе GeneSweep, неофициальный конкурс, начатый тут 3 года назад в геноме, видящемся в Холодной весенней лаборатории гавани (CSHL), в которой исследователи пробовали предположить, сколько кодирующих протеин последовательностей требуется для человека.В то время как он организовал водоем, Иван Бирни из европейского Университета Биоинформатики около Кембриджа, Англия, был уверен, что ответ будет в руке к настоящему времени.
Большая часть оценок сейчас, оказывается, было высоко. Кое-какие расположились вверх 70 000 либо 100 000 генов, и всего пару исследователей высказали предположение, что число имело возможность бы быть в два раза меньше либо даже меньше.
Потому, что программы упорядочения прибыли ближе в окончание генома человека, но, генное количество упало еще ниже – и более раздражающее, которым это стало для определения фактического числа. К примеру, Бирни оценивает, что с сегодняшними строгими параметрами и улучшенными программами генного предсказания, имело возможность бы быть 24 500 генов, из которых 3000 имели возможность бы быть «псевдогены», не создающие протеинов и исходя из этого не учитывающиеся.
Но существует мало не хорошо исследуемой последовательности ДНК – названная «чёрная материя» – что может содержать больше генов. Сталкивающийся с этой сложностью, Бирни считал, что обязан будет отложить выбирать победителя.Но тогда он сделал вывод, что, независимо от того что, «мы придумываем под30 000 генного количества», сказал он наконец о симпозиуме генома семь дней CSHL. И оказалось, что лишь пару заключающих пари помещают собственные деньги на числе тот низко.
Второй укос, программа упорядочения в Университете Системной биологии в Сиэтле, Вашингтон, были самыми родными – предсказание 25,947 в 2001. Так, Бирни сделал вывод, что она подобающа взять половину водоема за 1 200$.
Разделением второй половины приза был Пол Дир из английского Совета по медицинским изучениям, предположивший 27,462 в 2000, и Оливье Желлон из Genoscope в Эври, Франция, с 26 500 в 2002.Программа упорядочения кредитов второго укоса Джин Вейссенбак из Genoscope с влиянием на ее предсказание; пару лет назад, он высказал предположение, что число будет низким. «В то время, Все практически упали с их стула», Второй укос вспоминает.
Но сейчас это думается неоспоримым, что у людей имеется кодирующее протеин генное количество близко к тем из Caenorhabditis elegans либо Arabidopsis.