Исследователи протеомики в Швеции собираются выпустить базу данных через несколько дней, содержащую много тысяч изображений того, где разные протеины находятся в тканях и клетках человека. База данных, названная Атлас Протеина, предназначается, чтобы оказать помощь биохимикам идентифицировать функции не так давно найденных протеинов.Потому, что ученые начали упорядочивать человеческие гены в 1990-х, разбирание в сотовых местах протеинов каждого гена стало приоритетом, говорит Матиас Ахлен, биолог в Королевском Технологическом университете в Стокгольме, Швеция и директоре упрочнения по Атласу Протеина.
Методом давания представлений о функции протеинов он говорит, Атлас может ускорить их применение в качестве маркеров для целей препарата либо болезни. Пилотный проект 2 пару лет назад убедил Фонд Кнута и Алици Валленберг Швеции снабжать деньгами увеличенный Атлас Протеина в Сентябре 2007.
Для разыскивания места протеинов внутренние человеческие ткани бригада Ахлена примерно 100 ученых разламывает проблему в две части – нахождение антител, предназначающихся для отдельных протеинов и потом применяющий те антитела для охоты для протеинов в тканях. Для оптимизации этого процесса бригада Ахлена создала стандартизированные множества, содержащие микроскопические образцы от 48 видов обычной людской ткани и 20 типов опухолей. Антитела помечены для раскрытия, какие протеины выражены в каждой из разных тканей. Не обращая внимания на то, что новый атлас Сейчай содержит эти лишь по примерно 700 протеинам, бригада собирается заняться примерно 22 000 протеинов, один для каждого людской гена.
«Это – один из самых полезных наборов данных, которые Вы можете иметь», говорит Майкл Снайдер из Йельского университета, ведший подобное широкомасштабное упрочнение локализовать протеины в дрожжах. Набор данных дрожжей доказал значительный инструмент в сужении, трудятся ли протеины в ядре, клеточной мембране, либо в другом месте.Атлас Протеина все еще имеет морщины, которые будут сглажены.
В случае если антитела реагируют больше чем с одним протеином, множества ткани могут нечайно высветить непреднамеренные протеины. Бригада Ахлена будет рассчитывать на внешних специалистов для ослабления неприятностей.