Применяя замечательные упорядочивающие ДНК инструменты, созданные для проекта генома человека, ученые упорядочили частичные либо неспециализированные геномы сотен ранее малоизвестных микроорганизмов. Новое изучение подчеркивает огромное разнообразие микроорганизмов в открытом океане, и это имело возможность оказать помощь раскрыть главные роли микроорганизмов в управлении глобальной окружающей средой.Для понимания работ экосистемы экологи должны сперва идентифицировать существ, населяющих ее. Это тяжело для микробовых экологов, в силу того, что лишь примерно 1% микроорганизмов на Земле когда-либо выращивался в лаборатории.
Исследователи выяснили разновидности таких unculturable микроорганизмов методом идентификации обычных генетических отпечатков пальцев, но они говорят им мало об образах судьбы микроорганизмов – какие химикаты они жгут для энергии, к примеру, и как одна разновидность живет за счет траты другого.Для узнавания больше о методах открыто-океанских бактерий Дж. Крэйг Вентер из Университета Альтернатив Биологической энергии в Роквилле, Мэриленд и его сотрудниках забрал пробы воды из Саргассового моря, региона Океана центральной Атлантики неподалеку от берега Бермуд. После фильтрации воды для ловли лишь бактерий либо archaea они извлекли ДНК.
Тогда они разбили ДНК в меньшие фрагменты, упорядочили 1,05 миллиарда пар азотистых оснований и применяли компьютерные модели для восстановления частичных геномов разных разновидностей. Упрочнение, сказал онлайн 4 марта в Науке, стал причиной 148 совсем новым типам бактерий и 1,2 миллионам новых генов, практически на порядок больше генов, чем все прошлые объединенные изучения.В это же время Джилл Бэнфилд из Калифорнийского университета, Беркли и ее коллеги применяла подобные последовательные способы для сшивания совместно геномов микроорганизмов в весьма кислой воде от закинутого Калифорнийского золотого рудника. Они вернули геномы двух выносливых жуков и частично вернули те из трех вторых, все из которых сосуществовали как розовая биопленка.
Согласно отчету в выпуске 4 марта Природы, один таковой геном прибыл из жука, чей, ни при каких обстоятельствах обожает не упорядочивался; исследователи вывели большая часть его метаболических дорог и узнали, как это остается в живых на диете железа.Изучения открывают новые возможности раскрыть микробовые геномы от вторых окружающих сред, показывая, как микробы изменяют круговороты азота и глобальный углерод, как микробовый метаболизм, развитый, и как столько разных видов микроорганизмов может сосуществовать, говорит биологического океанографа Пола Фальковского из Университета Ратджерса в Нью-Брансуике, Нью-Джерси. “Это – лишь начало”.