Японская pufferfish, узнаваемая в первую очередь как возможно фатальный деликатес, если не подготовленный подобающим образом, планирует стать замечательным инструментом в семь дней. Сейчас, интернациональная бригада заявила, что она выяснила заказ большинства 300 миллионов баз, включающих геном животного, Fugu rubripes.
Потому, что лишь второй геном от позвоночного животного с целью достижения этой стадии завершения (второй являющийся человеком), последовательность Fugu уже оказывается нужным для приобретения знаний о геноме человека, исследователи заявили в Сан-Диего в 13-м Интернациональном Последовательном Геноме и Аналитическая Конференция.Больше чем десятилетие назад молекулярный биолог Сидни Бреннер из Университета Salk Биологических изучений в Ла-Хойе, Калифорния, начал стремиться к проекту генома Fugu, потому, что это имеет самый мелкий узнаваемый геном для позвоночного животного с генами, располагаемыми в полной мере близко друг к другу.
У рыбы также имеется мало некодирующей ДНК, сорвавшей геном, последовательный у мышей, людей и многих вторых организмов. В ноябре 2000 Университет Генома Сустава Министерства энергетики в Уолнат-Крике, Калифорния, решил оказать помощь Бреннеру реализовать собственную мечту, которой помогают коллеги в Сингапуре, Соединенном Королевстве, и Сиэтле, Вашингтон.
Присоединение позднее было двумя компаниями: Myriad Genetics Inc. в Солт-Лейк-Сити и Celera Genomics Inc. в Роквилле, Мэриленд.Вместо того, чтобы упорядочивать часть генома частью, как был сделан для проекта генома человека, бригада показала подход ружья целого генома, расколов целый геном в миллионы накладывающихся битов для упорядочивания. В большинстве случаев применяемый на микробах, этот способ был сперва применен к позвоночному геному – человек – Celera, перемещение, создавшее довольно много несоответствия.Эскиз Fugu сейчас содержит примерно 300 миллионов баз, устроенных в разъединенных канатно-веревочных отходах последовательности, названной лесами.
В среднем каждые леса покрывают 300 000 баз и возможно включают пару генов. Бригада сохраняет надежду заполнить и соединить эти канатно-веревочные отходы за следующие пару лет. Тем временем эскиз «есть весьма чистым инструментом» для идентификации ДНК, серьёзной для регуляции генов в людях, говорит член команды Грег Элгар из английского Информационного центра Картографирования Генома человека в Кембридже, Соединенное Королевство.
Вторая бригада ученых трудится над пресноводным геномом pufferfish.Успех к настоящему времени с Fugu «демистифицировал подход ружья целого генома», говорит Ричард Гиббс, директор центра генома в Медицинском колледже Бэйлора в Хьюстоне.
Что касается самого генома Fugu, «это – ответственное научное достижение», додаёт он.