Патологи растения будут получать собственный первый взор на полный геном двух разновидностей Фитофторы, подобный грибу патоген, вредящий огромному количеству растений. 10 июня программы упорядочения представили геном Фитофторы ramorum, причины неожиданной смерти дуба, и также Фитофторы sojae, что гниет корни сои.
Новые последовательности должны обеспечить понимание главных уловок патогенов и имели возможность обеспечить новые инструменты в борьбе с неожиданной смертью дуба, распространявшейся по всей стране (Наука, 26 марта, p. 1959).Упрочнение за практически $4 миллиона, финансируемое американским Министерством энергетики, американским Министерством сельского хозяйства, и Национальным научным фондом, началось в 2002 и было выполнено Совместным Университетом Генома САМКИ в Уолнат-Крике, Калифорния и Университете биоинформатики Вирджинии (VBI) в Блэксбурге. P. sojae был выбран, в силу того, что он отлично изучен и имеет довольно компактный геном. Это, выяснилось, было 95 мегаосновами продолжительно, тогда как P. ramorum, найденный лишь в 2000, был еще меньшими 65 мегаосновы.
Бретт Тайлер VBI говорит, что неспециализированные черты между двумя разновидностями имеют тенденцию ломаться в регионах, содержащих определенные для хозяина гены, предлагая широкую специализацию. Второе начальное открытие пребывает в том, что гены для протеинов раньше нападали, обороноспособность растения особенно в изобилии. «Они, думается, подвергаются весьма быстродействующему формированию», говорит Тайлер.Последовательность окажет помощь исследователям определить намного больше о том, как его хозяева и патоген взаимодействуют, и это имело возможность привести к иммунным растениям, говорит Чуаньсюэ Хун, патолог растения при Сельскохозяйственном Изучении университета штата и Политехнического института Вирджиния и Дополнительном Центре в Вирджинии-Бич. «В долговременной возможности [геномы] будут весьма большими», говорит Хун.Самая яркая выплата генома будет добрейшими методами идентифицировать и отследить P. ramorum, и новые опробования могли быть дешёвыми в течение года, Тайлер предвещает.
Геном также окажет помощь выяснить, активны ли два сцепляющихся типа P. ramorum сексуально в Северной Америке, которая подняла бы привидение увеличенной ядовитости и громадных кругов хозяев, говорит Маттео Гарбелотто из Калифорнийского университета, Беркли, лаборатория которого предоставила патогену для упорядочивания. «Мы вправду будем в состоянии прибить биологию организма». Он додаёт, что новые способы обнаружения, на базе ответа растения на протеины нападения Фитофторы, также существенно упростили бы опробование.