ТОКИО – Сейчас исследователи генетики взяли новый инструмент. База данных аннотируемых, человеческих дополнительных ДНК во всю длину (комплементарные ДНК), собранные интернациональной бригадой во главе с японскими исследователями, была открыта для открытого доступа.
База данных, как ожидают, будет благом для изучения, связанного с разработкой лекарственного средства, генной охотой, молекулярной эволюцией и сравнительной геномикой.комплементарная ДНК есть главным инструментом биотехнологии. Это – сделанная в лаборатории копия ДНК организма – кардинально, легко кодирующие протеин части – что исследователи придумывают применение фермента, названного обратной транскриптазой. В большинстве случаев, ДНК расшифрована в РНК, потом отредактировала и перевоплотила в протеины.
Обратная транскриптаза идет напротив, строя ген из его РНК посыльного. Это разрешает исследователям создать копии активных генов, не имея необходимость охотиться через неотредактированный геном.
Новая база данных объединяет и основывается на информации из шести основных проектов комплементарной ДНК, включая Генную Коллекцию млекопитающих американских Национальных Университетов Здоровья, германского Людской проекта комплементарной ДНК, работы над китайским Национальным Центром Генома человека в Шанхае и тремя проектами в Японии. Такаши Гойобори, помощник директора НИИ информации о Биопрепарате Японии в Токио, говорит, что ученые, вовлеченные в разные проекты, искали методы сделать их работу более дешёвой для всех исследователей и увеличить значение отдельных коллекций." Один проект не может касаться всего, но поместить их всех совместно, и они весьма дополнительны», говорит он.
База данных включает эти больше чем по 20 000 неповторимых последовательностей комплементарной ДНК, включая все известное о функции, структуре, характере экспрессии ткани, отношениях заболевания и ортологах в неспециализированных подопытных животных. Исследователи, желающие копию определенного клона комплементарной ДНК, могут войти в контакт с соответствующим университетом.
Второй марафон аннотирования держал в прошлом ноябре произведенные эти по 15 000 дополнительных клонов, которые будут загружены, когда они обрабатываются. База данных также подготовлена принять подчинение.
Анализ аннотируемых данных уже стал причиной идентификации нескольких тысяч ранее неопознанных генов-кандидатов. Гойобори мнит базу данных как окончательный репозиторий информации о комплементарных ДНК и разглядывает его как один из больших вкладов Японии в область.
Япония поздно начинала на своем вкладе в упрочнения по упорядочиванию генома человека, внося лишь примерно 6% общего числа. Наоборот, три японских проекта внесли примерно 60% информации о комплементарной ДНК, входящих в Базу данных H-Invitational. «Я пологаю, что японские исследователи желали сделать неповторимый вклад в геномные упрочнения», говорит он.