На этой неделе исследователи воображают кодекс ДНК одного из самых необыкновенных существ, упорядоченных сейчас: tunicate. Не обращая внимания на то, что взрослые этих маленьких морских животных являются обычными, мягкими беспозвоночными, их личиночная форма больше будет похожим форму позвоночных животных, и их геном держит главные подсказки к эволюционным трансформациям, случившимся при переходе между двумя.
Tunicates озадачивали биологов больше века. Взрослые живут приложенные к сваям, лодкам и камням. Их органы скрыты в кожистых ножнах либо тунике – из этого имя. Чарльз Дарвин считал, что они были родственниками моллюсков; в середине 1800-х, но, русский биолог Александр Ковалевский возразил, что мобильная tunicate личинка, с ее спинной хрящевой колонкой, напоминающей позвоночник, должна быть сгруппирована с позвоночными животными и не улитками и моллюсками – даже при том, что взрослый ни при каких обстоятельствах не развивает базу.
В начале 2001 Нори исследователей Satoh университета Киото в Японии и Майкла Левина и Дэниела Рохсэра из Калифорнийского университета, Беркли, убедила программы упорядочения в Университете Генома Сустава Министерства энергетики в Уолнат-Крике, Калифорния, брать tunicate Ciona intestinalis. Восемнадцать месяцев спустя примерно 50 биологов и bioinformaticists подробно изучили не так давно собранный геном эскиза.
Они идентифицировали столько генов, сколько они имели возможность и сравнили последовательность с существующей информацией о геноме, сосредотачивающейся о том, как разные типы генов изменились в течение времени.117 миллионов упорядоченных баз tunicate включают приблизительно 16 000 генов. Геном разделяет примерно 60% собственных генов с другими беспозвоночными, вполне упорядоченными, такими как нематод и дрозофила, в то время как примерно 5% соответствуют последовательностям, отысканным лишь – до сих пор, по крайней мере – в человеке, мыши и геномах рыбы puffer. И примерно 20% кажутся неповторимыми для Ciona, включая пару вовлеченные в производство твёрдого крахмала, названного клетчаткой, главным компонентом в его тунике.
О итогах информируют в выпуске 13 декабря Науки.Последовательность «окажет помощь нам расстегнуть молнию на нескольких эволюционных трансформациях, случившихся при переходе между беспозвоночными и позвоночными животными», говорит Паоло Сордино из Зоологической Станции в Неаполе, Италия.
И, «потому, что любой полный геном разворачивается», говорит Шон Кэрролл, развития и исследователь развития в университете Висконсина, Мадисона, «мы приобретаем громадную и добрейшую картину образцов семейств генов и генного развития».