Генные «американские горки» поднимаются выше

генома человека

БОСТОН – В то время как последовательность генома человека эскиза была закончена в прошедшем сезоне, компьютерный анализ высказал предположение, что число генов было отвратительно мелким. Сейчас, экспериментальный подход предполагает, что число может практически быть намного ближе к раннему предсказанию 70 000 генов, согласно представлению 16 февраля на годовом собрании Американской ассоциации содействия формированию науки, издателе ScienceNOW.

Действующий в течении всего дня сеанс, начатый невинно достаточно. Эрик Ландер из Университета Белых угрей Биомедицинского Изучения в Кембридже, Массачусетс, фаворите проекта генома человека, сообщил постоянной помещении лишь аудиторию, что его добрейшее предположение было все еще, что существует примерно 32 000 людских генов. Это основывается на аннотации, процессе предсказания, какие протяжения ДНК содержат гены методом доверия специальному ПО для идентификации аналогичных гену последовательностей в ДНК.Позднее в тот же день Виктор Велкулеску установил мелкое восстание методом увеличения генного количества.

Он и его коллеги, в Университете Джонса Хопкинса в Балтиморе, возвратились в лабораторию для поиска генов та пропущенная аннотация. Их способ, названный последовательным анализом экспрессии гена (SAGE), трудится методом прослеживания молекул РНК назад до их источников ДНК. После изоляции РНК от разных людских тканей исследователи копируют его в ДНК, от которой они выключают собственного рода генетический штрихкод 10 – 20 пар азотистых оснований.

Большинство этих показателей уникально для единственного гена. Показатели могут тогда быть если сравнивать с геномом человека, чтобы определить, совпадают ли они с генами, найденными аннотацией.

Велкулеску заявил, что лишь добрая половина показателей соответствует annonated генам – доказательства, они говорят, что аннотация недооценила человеческие гены инвентаря примерно половиной.Причина неравенства может пребывать в том, что стандартный компьютерный способ аннотации был по большей части развит для геномов несложных (прокариотических) организмов, не для более сложных последовательностей, отысканных в геномах других эукариотов и людей. «Мы все еще не весьма добры в предсказании генов у эукариотов», сообщила Клэр Фрейзер из Университета Геномного Изучения в Роквилле, Мэриленд.

Совсем быть может, что могло быть больше чем 32 000 генов, и SAGE есть серьёзным подходом к нахождению их, говорит она. «Вы полностью должны возвратиться в лабораторию и убежать от компьютерного терминала».


BEECAMP.RU